inquirybg

Gjenetika e popullatës në të gjithë gjenomin dhe monitorimi molekular i rezistencës ndaj insekticideve në mushkonjat Anopheles në Sebatkilo, Awash, Etiopi

Që nga zbulimi i saj në Xhibuti në vitin 2012, mushkonja aziatike Anopheles stephensi është përhapur në të gjithë Bririn e Afrikës. Ky vektor pushtues vazhdon të përhapet në të gjithë kontinentin, duke paraqitur një kërcënim serioz për programet e kontrollit të malaries. Metodat e kontrollit të vektorëve, duke përfshirë rrjetat e shtratit të trajtuara me insekticide dhe spërkatjen e mbetjeve të ambienteve të mbyllura, kanë ulur ndjeshëm barrën e malaries. Megjithatë, përhapja në rritje e mushkonjave rezistente ndaj insekticideve, duke përfshirë popullatat e Anopheles stephensi, po pengon përpjekjet e vazhdueshme për eliminimin e malaries. Të kuptuarit e strukturës së popullatës, rrjedhës së gjeneve midis popullatave dhe shpërndarjes së mutacioneve të rezistencës ndaj insekticideve është thelbësore për të udhëhequr strategji efektive të kontrollit të malaries.
Përmirësimi i të kuptuarit tonë se si An. stephensi u vendos kaq shumë në HOA është thelbësor për parashikimin e përhapjes së tij të mundshme në zona të reja. Gjenetika e popullatës është përdorur gjerësisht për të studiuar speciet vektoriale për të fituar njohuri mbi strukturën e popullatës, përzgjedhjen e vazhdueshme dhe rrjedhën e gjeneve18,19. Për An. stephensi, studimi i strukturës së popullatës dhe strukturës së gjenomit mund të ndihmojë në sqarimin e rrugës së saj të pushtimit dhe çdo evolucioni adaptiv që mund të ketë ndodhur që nga shfaqja e saj. Përveç rrjedhës së gjeneve, përzgjedhja është veçanërisht e rëndësishme sepse mund të identifikojë alelet e shoqëruara me rezistencën ndaj insekticideve dhe të hedhë dritë mbi mënyrën se si këto alele po përhapen nëpër popullatë20.
Deri më sot, testimi i shënuesve të rezistencës ndaj insekticideve dhe gjenetikës së popullatës në specien pushtuese Anopheles stephensi është kufizuar në disa gjene kandidate. Shfaqja e specieve në Afrikë nuk është kuptuar plotësisht, por një hipotezë është se ato janë sjellë nga njerëzit ose bagëtitë. Teori të tjera përfshijnë migrimin në distanca të gjata nga era. Izolatet etiopiane të përdorura në këtë studim u mblodhën në Awash Sebat Kilo, një qytet i vendosur 200 km në lindje të Addis Ababa dhe në korridorin kryesor të transportit nga Adis Ababa në Xhibuti. Awash Sebat Kilo është një zonë me transmetim të lartë të malaries dhe ka një popullatë të madhe të Anopheles stephensi, e cila raportohet të jetë rezistente ndaj insekticideve, duke e bërë atë një vend të rëndësishëm për studimin e gjenetikës së popullatës së Anopheles stephensi8.
Mutacioni i rezistencës ndaj insekticideve kdr L1014F u zbulua me frekuencë të ulët në popullatën etiopiane dhe nuk u zbulua në mostrat fushore indiane. Ky mutacion kdr jep rezistencë ndaj piretroideve dhe DDT-së dhe është zbuluar më parë në popullatat e An. stephensi të mbledhura në Indi në vitin 2016 dhe në Afganistan në vitin 2018.31,32 Pavarësisht provave të rezistencës së përhapur ndaj piretroideve në të dy qytetet, mutacioni kdr L1014F nuk u zbulua në popullatat e Mangalore dhe Bangalore të analizuara këtu. Përqindja e ulët e izolateve etiopiane që mbanin këtë SNP që ishin heterozigotë sugjeron që mutacioni u shfaq kohët e fundit në këtë popullatë. Kjo mbështetet nga një studim i mëparshëm në Awash që nuk gjeti prova të mutacionit kdr në mostrat e mbledhura në vitin para atyre të analizuara këtu.18 Ne më parë e identifikuam këtë mutacion kdr L1014F me frekuencë të ulët në një grup mostrash nga i njëjti rajon/vit duke përdorur një qasje zbulimi amplikoni.28 Duke pasur parasysh rezistencën fenotipike në vendet e marrjes së mostrave, frekuenca e ulët e aleleve të këtij shënuesi të rezistencës sugjeron që mekanizma të tjerë përveç modifikimit të vendit të synuar janë përgjegjës për këtë fenotip të vëzhguar.
Një kufizim i këtij studimi është mungesa e të dhënave fenotipike mbi përgjigjen ndaj insekticideve. Studime të mëtejshme që kombinojnë sekuencimin e të gjithë gjenomit (WGS) ose sekuencimin e amplikoneve të synuara në kombinim me biotestet e ndjeshmërisë janë të nevojshme për të hetuar ndikimin e këtyre mutacioneve në përgjigjen ndaj insekticideve. Këto SNP të reja me sens të gabuar që mund të shoqërohen me rezistencë duhet të synohen për analiza molekulare me rendiment të lartë për të mbështetur monitorimin dhe për të lehtësuar punën funksionale për të kuptuar dhe validuar mekanizmat e mundshëm që lidhen me fenotipet e rezistencës.
Si përmbledhje, ky studim ofron një kuptim më të thellë të gjenetikës së popullatës së mushkonjave Anopheles në të gjithë kontinentet. Zbatimi i analizës së sekuencimit të të gjithë gjenomit (WGS) në grupe më të mëdha mostrash në rajone të ndryshme gjeografike do të jetë çelësi për të kuptuar rrjedhën e gjeneve dhe për të identifikuar shënuesit e rezistencës ndaj insekticideve. Kjo njohuri do t'u mundësojë autoriteteve të shëndetit publik të bëjnë zgjedhje të informuara në mbikëqyrjen e vektorëve dhe përdorimin e insekticideve.
Ne përdorëm dy qasje për të zbuluar ndryshimin e numrit të kopjeve në këtë grup të dhënash. Së pari, përdorëm një qasje të bazuar në mbulim që u përqendrua në grupet e identifikuara të gjeneve CYP në gjenom (Tabela Plotësuese S5). Mbulimi i mostrës u mesatarizua në të gjitha vendet e mbledhjes dhe u nda në katër grupe: Etiopia, fushat indiane, kolonitë indiane dhe kolonitë pakistaneze. Mbulimi për secilin grup u normalizua duke përdorur zbutjen e bërthamës dhe më pas u paraqit në grafik sipas thellësisë mesatare të mbulimit të gjenomit për atë grup.


Koha e postimit: 23 qershor 2025